Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Timm29Q8BGX2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Timm29Q8BGX2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Timm29Q8BGX2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Timm29Q8BGX2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Timm29Q8BGX2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Timm29Q8BGX2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Timm29Q8BGX2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Timm29Q8BGX2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Timm29Q8BGX2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Timm29Q8BGX2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Timm29Q8BGX2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Timm29Q8BGX2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Timm29Q8BGX2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Timm29Q8BGX2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Timm29Q8BGX2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Timm29Q8BGX2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Timm29Q8BGX2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Timm29Q8BGX2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Timm29Q8BGX2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms