Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Best2Q8BGM5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms