Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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