Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf187Q8BFX1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf187Q8BFX1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf187Q8BFX1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.8 ms