Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms