Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atf7ipQ7TT18 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf7ipQ7TT18 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms