Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf516Q7TSH3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Znf516Q7TSH3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Znf516Q7TSH3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf516Q7TSH3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms