Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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