Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmc3Q7TQ69 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmc3Q7TQ69 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmc3Q7TQ69 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmc3Q7TQ69 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms