Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp3Q7TNH6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nphp3Q7TNH6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp3Q7TNH6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms