Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkd1l2Q7TN88 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd1l2Q7TN88 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd1l2Q7TN88 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd1l2Q7TN88 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd1l2Q7TN88 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd1l2Q7TN88 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms