Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcg2Q7TMS5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcg2Q7TMS5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Abcg2Q7TMS5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms