Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf2Q7TMI3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uhrf2Q7TMI3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms