Protein–RNA interactions for Protein: Q7M760

Zranb1, Ubiquitin thioesterase Zranb1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zranb1Q7M760 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zranb1Q7M760 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Zranb1Q7M760 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Zranb1Q7M760 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zranb1Q7M760 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zranb1Q7M760 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zranb1Q7M760 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zranb1Q7M760 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zranb1Q7M760 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zranb1Q7M760 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zranb1Q7M760 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zranb1Q7M760 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Zranb1Q7M760 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zranb1Q7M760 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms