Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usmg5Q78IK2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms