Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssh1Q76I79 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssh1Q76I79 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssh1Q76I79 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssh1Q76I79 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssh1Q76I79 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssh1Q76I79 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssh1Q76I79 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssh1Q76I79 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssh1Q76I79 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssh1Q76I79 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssh1Q76I79 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ssh1Q76I79 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms