Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nme8Q715T0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Nme8Q715T0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms