Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl35Q6ZWV7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms