Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nemp1Q6ZQE4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms