Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnt1Q6ZPR4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms