Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LcorQ6ZPI3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms