Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc44a1Q6X893 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms