Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cxcl3Q6W5C0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms