Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9c1Q6UJY2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9c1Q6UJY2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9c1Q6UJY2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9c1Q6UJY2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9c1Q6UJY2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9c1Q6UJY2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9c1Q6UJY2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9c1Q6UJY2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9c1Q6UJY2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc9c1Q6UJY2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc9c1Q6UJY2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc9c1Q6UJY2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc9c1Q6UJY2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc9c1Q6UJY2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc9c1Q6UJY2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms