Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd300lfQ6SJQ7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.6 ms