Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf3Q6QR59 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms