Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF5

Bms1, BMS1 homolog, ribosome assembly protein (Yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bms1Q6PGF5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bms1Q6PGF5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Bms1Q6PGF5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms