Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Znf316Q6PGE4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf316Q6PGE4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf316Q6PGE4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms