Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scaf4Q6PFF0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms