Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmeff1Q6PFE7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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