Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb39Q6PDK0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbtb39Q6PDK0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms