Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms