Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig8Q6P3A4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig8Q6P3A4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig8Q6P3A4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig8Q6P3A4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig8Q6P3A4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vsig8Q6P3A4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms