Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg2f1Q6P3A2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frg2f1Q6P3A2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms