Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrimpolQ6P1E7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PrimpolQ6P1E7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms