Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZR2

Msantd2, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd2Q6NZR2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msantd2Q6NZR2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msantd2Q6NZR2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msantd2Q6NZR2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msantd2Q6NZR2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msantd2Q6NZR2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msantd2Q6NZR2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msantd2Q6NZR2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Msantd2Q6NZR2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msantd2Q6NZR2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msantd2Q6NZR2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Msantd2Q6NZR2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.5 ms