Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp140Q6NSQ5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sp140Q6NSQ5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sp140Q6NSQ5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sp140Q6NSQ5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sp140Q6NSQ5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sp140Q6NSQ5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sp140Q6NSQ5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sp140Q6NSQ5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Sp140Q6NSQ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sp140Q6NSQ5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Sp140Q6NSQ5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sp140Q6NSQ5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sp140Q6NSQ5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sp140Q6NSQ5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sp140Q6NSQ5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms