Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Best3Q6H1V1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Best3Q6H1V1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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