Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nckap5lQ6GQX2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nckap5lQ6GQX2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nckap5lQ6GQX2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms