Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Edrf1Q6GQV7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Edrf1Q6GQV7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Edrf1Q6GQV7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Edrf1Q6GQV7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edrf1Q6GQV7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Edrf1Q6GQV7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Edrf1Q6GQV7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Edrf1Q6GQV7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Edrf1Q6GQV7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Edrf1Q6GQV7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Edrf1Q6GQV7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Edrf1Q6GQV7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Edrf1Q6GQV7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Edrf1Q6GQV7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Edrf1Q6GQV7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Edrf1Q6GQV7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms