Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp11bQ6DFW5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp11bQ6DFW5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp11bQ6DFW5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms