Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdzrn3Q69ZS0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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