Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cntn4Q69Z26 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cntn4Q69Z26 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms