Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sptbn2Q68FG2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sptbn2Q68FG2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms