Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf280dQ68FE8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Znf280dQ68FE8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf280dQ68FE8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf280dQ68FE8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms