Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CltcQ68FD5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
CltcQ68FD5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CltcQ68FD5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms