Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprjQ64455 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprjQ64455 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms