Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt12Q64291 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt12Q64291 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms