Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ifit1Q64282 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifit1Q64282 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms