Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr2e1Q64104 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2e1Q64104 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms